RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A1P53007 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DGCR6Q14129 220 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SSX2Q16385 188 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CBLL1Q75N03 491 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CDH26Q8IXH8 852 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FTMTQ8N4E7 242 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR52D1Q9H346 318 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SP140LQ9H930 580 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 USE1Q9NZ43 259 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MBD2Q9UBB5 411 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LRP12Q9Y561 859 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF320A2RRD8 509 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF878C9JN71 531 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GSTA4O15217 222 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZFPL1O95159 310 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SPARCP09486 303 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PSG2P11465 335 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CCL3L1P16619 93 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SLC15A1P46059 708 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CX3CR1P49238 355 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DGCR2P98153 550 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PRDX4Q13162 271 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 COTL1Q14019 142 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 COQ5Q5HYK3 327 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CASC10Q5T4H9 136 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FAM57BQ71RH2 274 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SPARTQ8N0X7 666 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T27Q8NH04 317 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MUC7Q8TAX7 377 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SDSLQ96GA7 329 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RNF170Q96K19 258 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR10A2Q9H208 303 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ABCB9Q9NP78 766 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GID8Q9NWU2 228 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CXCR6O00574 342 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2CO00762 179 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A17O43808 307 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 IDH3BO43837 385 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINA1P01009 418 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 APOC1P02654 83 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PSKH1P11801 424 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 HSD11B1P28845 292 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ENTPD1P49961 510 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR12D2P58182 307 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SLC34A1Q06495 639 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SEC23BQ15437 767 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MAPRE2Q15555 327 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 Q3ZCU0 254 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 KLHL12Q53G59 568 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TIGD4Q8IY51 512 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T4Q8NH00 348 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR52J3Q8NH60 311 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PIGCQ92535 297 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TFAP2CQ92754 450 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ASCL2Q99929 193 aa7.3□□□□□ -1.24
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