RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 TEX261Q6UWH6 196 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 COMMD2Q86X83 199 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TMEM163Q8TC26 289 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 REEP6Q96HR9 211 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 Q96MT0 163 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 JMJD8Q96S16 334 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TREM2Q9NZC2 230 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 KIF25Q9UIL4 384 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 U3KQ87 197 aa7.33□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 A6NLC8 198 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PPIAL4DF5H284 164 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 RGS5O15539 181 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 FAM20BO75063 409 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PNPP00491 289 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 C4BPBP20851 252 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MAP2K3P46734 347 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 DAPP51397 102 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ACTC1P68032 377 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ACTA1P68133 377 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 EGR3Q06889 387 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ZNF273Q14593 569 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OTPQ5XKR4 325 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 FAM57BQ71RH2 274 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 COMMD7Q86VX2 200 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TIGD4Q8IY51 512 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MARC2Q969Z3 335 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 SPSB4Q96A44 273 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OR8B2Q96RD0 313 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TEAD3Q99594 435 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MRI1Q9BV20 369 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MED20Q9H944 212 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 GCM1Q9NP62 436 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ING4Q9UNL4 249 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 HSPB11Q9Y547 144 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 CACNG2Q9Y698 323 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TMEM210A6NLX4 147 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ZAR1LA6NP61 321 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TMEM178BH3BS89 294 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MYL12BO14950 172 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 IGHV2-5P01817 119 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 HLA-DQB1P01920 261 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 CLUP10909 449 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MYL12AP19105 171 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 CA6P23280 308 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 MAP2K4P45985 399 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 NPY4RP50391 375 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 CD83Q01151 205 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 CD276Q5ZPR3 534 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 PLET1Q6UQ28 207 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.32□□□□□ -1.24
USP3-208ENST00000558285 Q8TCH9 128 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms