RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 M6PRP20645 277 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SPINK9Q5DT21 86 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 CCDC190Q86UF4 302 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR3A1P47881 315 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SELENOPP49908 381 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SLC35B1P78383 322 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 CDK5R1Q15078 307 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 RNF141Q8WVD5 230 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 NRTNQ99748 197 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR51I2Q9H344 312 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SLC25A22Q9H936 323 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 RABAC1Q9UI14 185 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 LPAR6P43657 344 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SSX8Q7RTT4 187 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 ADGRG7Q96K78 797 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 ATP5SQ99766 215 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PF4P02776 101 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 WNT1P04628 370 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 VDAC1P21796 283 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 CD80P33681 288 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 KISS1Q15726 138 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 BLNKQ8WV28 456 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR8B4Q96RC9 309 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.39□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PPIAL4DF5H284 164 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PEX11BO96011 259 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 COX5AP20674 150 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 YIPF5Q969M3 257 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 VSTM2LQ96N03 204 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 ZAR1LA6NP61 321 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MBP02144 154 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 LIMK1P53667 647 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 ASB10Q8WXI3 467 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR5B21A6NL26 309 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 ZNF724A8MTY0 619 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SOX15O60248 233 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SCO1O75880 301 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SBK3P0C264 359 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SLC25A4P12235 298 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 CDH26Q8IXH8 852 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 EID2BQ96D98 161 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 BTF3L4Q96K17 158 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 LINC00052Q96N35 136 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 DIRC2Q96SL1 478 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 GPR35Q9HC97 309 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 AUP1Q9Y679 476 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SERPINE3A8MV23 424 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MPZL1O95297 269 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 HAND1O96004 215 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 PDLIM4P50479 330 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 FOXL2P58012 376 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 CBLN3Q6UW01 205 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 BTNL8Q6UX41 500 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 MDP1Q86V88 176 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 OR6X1Q8NH79 312 aa7.38□□□□□ -1.23
GATB-212ENST00000515564 SAP25Q8TEE9 199 aa7.38□□□□□ -1.23
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