RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TECTB	Q96PL2	329 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF69	Q9UC07	566 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	HHLA2	Q9UM44	414 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GTI1	187 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5B21	A6NL26	309 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF205	O95201	554 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OCM2	P0CE71	109 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FAH	P16930	419 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL1	P22362	96 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R43	P59537	309 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTG1	P63261	375 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MICB	Q29980	383 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM201A	Q5SY85	155 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ITPKC	Q96DU7	683 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		14.36	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK1	P06493	297 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR3DL2	P43630	455 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG3	P63215	75 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXL1	Q12952	345 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZSR3	168 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PP6455	Q8WZ26	134 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF649	Q9BS31	505 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ESM1	Q9NQ30	184 aa		14.35	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SRRM5	B3KS81	715 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF879	B4DU55	563 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	HKR1	P10072	659 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CFP	P27918	469 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP78	Q5JTW2	689 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR82	Q6UXN9	313 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RDH10	Q8IZV5	341 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MND1	Q9BWT6	205 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NOX4	Q9NPH5	578 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		14.34	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF732	B4DXR9	585 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BSH0	61 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM20	O43506	726 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS10	O43665	173 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GPM6A	P51674	278 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT4	P56705	351 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD1	Q15116	288 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RNLS	Q5VYX0	342 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF573	Q86YE8	665 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A28	Q96A46	364 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		14.33	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C22orf46	C9J442	243 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf80	F5H4A9	247 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CD2	P06729	351 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT6	P51993	359 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BAMBI	Q13145	260 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR157	Q5UAW9	335 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM42	Q69YG0	159 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM86B	Q8N661	226 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR148	Q8TDV2	347 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FGGY	Q96C11	551 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR173	Q9NS66	373 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DHDH	Q9UQ10	334 aa		14.32	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	KPTN	Q9Y664	436 aa		14.32	□□□□□ -0.12

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