RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 A0A0B4J2A0 478 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ADAP1O75689 374 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GBAP04062 536 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SERPINF1P36955 418 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PSG6Q00889 435 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CDK5R1Q15078 307 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 AWAT2Q6E213 333 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RAB8BQ92930 207 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PARP11Q9NR21 331 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 V9GY05 133 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PS29 197 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 M0QZ24 198 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GTF2F2P13984 249 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FABP4P15090 132 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PSMB6P28072 239 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF843Q8N446 348 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR7G2Q8NG99 324 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GPR173Q9NS66 373 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CCSO14618 274 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PIN1P1O15428 100 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CLDN12P56749 244 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RAP1BP61224 184 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FUT5Q11128 374 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF141Q15928 474 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 EXTL1Q92935 676 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 MED20Q9H944 212 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 MSL2Q9HCI7 577 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NOX4Q9NPH5 578 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.74□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TRDCB7Z8K6 153 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 DVL1O14640 695 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CTAG2O75638 210 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR2C1O95371 312 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HPNP05981 417 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ARR3P36575 388 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 KLRB1Q12918 225 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 LEMD1Q68G75 181 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 LPAR4Q99677 370 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR10A5Q9H207 317 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TVP23AA6NH52 213 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 K7EM74 188 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZFAND5O76080 213 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CD3DP04234 171 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 AQP2P41181 271 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SULT1A2P50226 295 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PLAURQ03405 335 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NSDHLQ15738 373 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 UBE2V2Q15819 145 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TERB2Q8NHR7 220 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 DGAT2Q96PD7 388 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RASL10BQ96S79 203 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RNF2Q99496 336 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.73□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.73□□□□□ -1.33
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