RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478365.1

DDX39B-218, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-218ENST00000478365 GSK3AP49840 483 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MEOX2P50222 304 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CXCR4P61073 352 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LMO4P61968 165 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ACTA2P62736 377 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ACTG2P63267 376 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 FAM3AP98173 230 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MVKQ03426 396 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 COTL1Q14019 142 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TTC23Q5W5X9 447 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 UTS2BQ765I0 119 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 NAA40Q86UY6 237 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SETD9Q8NE22 299 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MICU1Q9BPX6 476 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 BEX2Q9BXY8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MMP27Q9H306 513 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GCM1Q9NP62 436 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MIOXQ9UGB7 285 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 R4GMQ9 66 aa6.7□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 A0A0G2JMP0 313 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 A0A0X1KG70 313 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LRP5LA4QPB2 252 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 METTL15A6NJ78 407 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 F5H5P2 479 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SLC16A6O15403 523 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 RGS5O15539 181 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MLNRO43193 412 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 IGHV2-70P01814 119 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 S100A8P05109 93 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 FABP1P07148 127 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SMIM6P0DI80 62 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CA6P23280 308 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CFHR2P36980 270 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GABARAPL2P60520 117 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 IL18R1Q13478 541 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TMEM65Q6PI78 240 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 COMMD2Q86X83 199 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TMEM186Q96B77 213 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 C10orf35Q96D05 121 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 POM121Q96HA1 1249 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TECTBQ96PL2 329 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 AMELYQ99218 206 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 BRD7Q9NPI1 651 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 BIN3Q9NQY0 253 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 FAM206AQ9NX38 181 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TREM2Q9NZC2 230 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 RNF7Q9UBF6 113 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 COPS3Q9UNS2 423 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.69□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 COL6A5A8TX70 2615 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR5B21A6NL26 309 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 A6NLC8 198 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 A8MXK9 166 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 E9PQ18 207 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 H0YAE9 185 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 M0R129 80 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LGALS8O00214 317 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 DHRS3O75911 302 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HTR3BO95264 441 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 DHFRP00374 187 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SELLP14151 372 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SRD5A1P18405 259 aa6.68□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZP3P21754 424 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms