RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 VCX3BQ9H321 246 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 AMBNQ9NP70 447 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 GPR173Q9NS66 373 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 CTSZQ9UBR2 303 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-211ENST00000476336 CYB5AP00167 134 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PGA5P0DJD9 388 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZNF20P17024 532 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 KIR3DL2P43630 455 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RBP2P50120 134 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SLC34A1Q06495 639 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 METTL11BQ5VVY1 283 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZNF788Q6ZQV5 615 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CMTM4Q8IZR5 234 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZNF676Q8N7Q3 588 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CCL13Q99616 98 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 AASSQ9UDR5 926 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZNF879B4DU55 563 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SLC1A7O00341 560 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SIGLEC5O15389 551 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RHBDL1O75783 438 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ALX3O95076 343 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OCM2P0CE71 109 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PIPP12273 146 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ATP1B3P54709 279 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 HILS1P60008 231 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PDCD1Q15116 288 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 MKXQ8IYA7 352 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZNF561Q8N587 486 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ST8SIA4Q92187 359 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TMEM80Q96HE8 168 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RHOFQ9HBH0 211 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 KPTNQ9Y664 436 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PPH5 198 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 C22orf46C9J442 243 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TRIM77I1YAP6 450 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TOX4O94842 621 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 NXPH2O95156 264 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 MT-ND2P03891 347 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CD2P06729 351 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 LIMS3P0CW19 117 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 LIMS4P0CW20 117 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 UBE2V2Q15819 145 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 GPR157Q5UAW9 335 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 RDH10Q8IZV5 341 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SDSLQ96GA7 329 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 WDFY2Q96P53 400 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZNF649Q9BS31 505 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 HES4Q9HCC6 221 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 A6NIN4 97 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 H0YHG0 523 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 ZFPL1O95159 310 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 CLIC3O95833 236 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PLATP00750 562 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 KNG1P01042 644 aa11.05□□□□□ -0.64
PRAME-211ENST00000476336 PSG2P11465 335 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms