RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 WDR86Q86TI4 376 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OR10AD1Q8NGE0 317 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OR51T1Q8NGJ9 327 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0A6YYH2 397 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 A6NJ64 397 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ZG16O60844 167 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 TPPPO94811 219 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CSTBP04080 98 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 NPBWR2P48146 333 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SRP9P49458 86 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OR8G1Q15617 311 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 RAB12Q6IQ22 244 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SLC22A25Q6T423 547 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CENPSQ8N2Z9 138 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CHST4Q8NCG5 386 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OR10R2Q8NGX6 335 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CHPT1Q8WUD6 406 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CYYR1Q96J86 154 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 MICU1Q9BPX6 476 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SYT3Q9BQG1 590 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 KLK11Q9UBX7 282 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 NDRG3Q9UGV2 375 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 PLCE1Q9P212 2302 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GABARAPH6UMI1 98 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 DEFA1P59665 94 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 DEFA3P59666 94 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 C15orf40Q8WUR7 153 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 FCAMRQ8WWV6 532 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SLAMF9Q96A28 289 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 RTL8AQ9BWD3 113 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OR51I2Q9H344 312 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 NGBQ9NPG2 151 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ICE1Q9Y2F5 2266 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SYNGR1O43759 233 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 INPP1P49441 399 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GUCA2AQ02747 115 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 TFF3Q07654 80 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 FAM89BQ8N5H3 189 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 NUP37Q8NFH4 326 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 MTCH1Q9NZJ7 389 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ORC5O43913 435 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 IGHV3-13P01766 116 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CHRM2P08172 466 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM50BP56557 158 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GPR176Q14439 515 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OXA1LQ15070 435 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 FAM76BQ5HYJ3 339 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 DCDC5Q6ZRR9 648 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF573Q86YE8 665 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 LRRC46Q96FV0 321 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SSX4O60224 188 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GTF2F2P13984 249 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GNB3P16520 340 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF260Q3ZCT1 412 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CDNFQ49AH0 187 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 PLAC9Q5JTB6 97 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ADAM5Q6NVV9 412 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 TM2D1Q9BX74 207 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CA10Q9NS85 328 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 IL36GQ9NZH8 169 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM235A6NFC5 223 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 F8VVB4 439 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 F8VWA3 439 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 BCL3P20749 454 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 PRSS3P35030 304 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GDNFP39905 211 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 RPS23P62266 143 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 DNM1P46Q6ZS02 220 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GDPD3Q7L5L3 318 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 F5H5P2 479 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ASAH1Q13510 395 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM16LQ309B1 348 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 NCMAPQ5T1S8 102 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 FBXL14Q8N1E6 418 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OR56B1Q8NGI3 324 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 OR13G1Q8NGZ3 307 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SETD6Q8TBK2 473 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 AQP3Q92482 292 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 PLPPR2Q96GM1 343 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 Q96M66 194 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 HS3ST6Q96QI5 342 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ATP23Q9Y6H3 246 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-207ENST00000472863 B8ZZF3 427 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-207ENST00000472863 RHBDL1O75783 438 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-207ENST00000472863 SCGNO76038 276 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-207ENST00000472863 GABRR1P24046 479 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-207ENST00000472863 SORDQ00796 357 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXB3-207ENST00000472863 PIGYQ3MUY2 71 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms