RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GINS4Q9BRT9 223 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 PECRQ9BY49 303 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CST11Q9H112 138 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 POFUT1Q9H488 388 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 BANF2Q9H503 90 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CALHM2Q9HA72 323 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GPR173Q9NS66 373 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF581Q9P0T4 197 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 DKK4Q9UBT3 224 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 WASF3Q9UPY6 502 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 VSIG4Q9Y279 399 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SPTBN2O15020 2390 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GWJ7 208 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINE3A8MV23 424 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 J3QW42 95 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 CGAP01215 116 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 AMY2AP04746 511 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINA5P05154 406 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 TPOP07202 933 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OR4E1P0C645 316 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF24P17028 368 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 HRH1P35367 487 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 ARR3P36575 388 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 CBX5P45973 191 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 ACTBL2Q562R1 376 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZS92 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF101Q8IZC7 436 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 PRRT1Q99946 306 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 BEX1Q9HBH7 125 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 GLRX2Q9NS18 164 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 STARD10Q9Y365 291 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 IGF2RP11717 2491 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 HMSDA8MTL9 139 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.85□□□□□ -1.63
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