RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299736.4

CENPV-201, Transcript of centromere protein V, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPV, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPV-201ENST00000299736 TMEM200BQ69YZ2 307 aa20.55■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.55■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 TEAD3Q99594 435 aa20.55■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 SLC25A19Q9HC21 320 aa20.55■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 USE1Q9NZ43 259 aa20.55■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 NOTCH3Q9UM47 2321 aa20.55■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 DSCAML1Q8TD84 2053 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 E2F6O75461 281 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 NRASP01111 189 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 PGA5P0DJD9 388 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ANXA8P13928 327 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 PRDX2P32119 198 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 LGALS4P56470 323 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ROM1Q03395 351 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ZNF684Q5T5D7 378 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 SAMD5Q5TGI4 173 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ZNF488Q96MN9 340 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 OR8B4Q96RC9 309 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.54■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 J3QT63 122 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 SYNGR1O43759 233 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 CHST1O43916 411 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 DHRS3O75911 302 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 HAAOP46952 286 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 BMXP51813 675 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 RIDAP52758 137 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 FBLN7Q53RD9 439 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ZNF573Q86YE8 665 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 OR2T27Q8NH04 317 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 PIFOQ8TCI5 191 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 C1orf21Q9H246 121 aa20.53■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 AQP12BA6NM10 295 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 PRR32B1ATL7 298 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 VSIG10L2P0DP72 767 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 COX7A1P24310 79 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 ERVFRD-1P60508 538 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 SNAPC1Q16533 368 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 OR4M1Q8NGD0 313 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.52■□□□□ 0.88
CENPV-201ENST00000299736 MEGF11A6BM72 1044 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 CCDC182A6NF36 153 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 NXPH2O95156 264 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 CCL3L1P16619 93 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 PRKACGP22612 351 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 CALHM1Q8IU99 346 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 COPS3Q9UNS2 423 aa20.51■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 VGLL3A8MV65 326 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 TTRP02766 147 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 T-ENOLP0DO92 83 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 ZNF273Q14593 569 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 TMEM42Q69YG0 159 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 NRIP2Q9BQI9 281 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.5■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 DLGAP1O14490 977 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 TK1P04183 234 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 REC114Q7Z4M0 266 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 CDCA4Q9BXL8 241 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 ZNF702PQ9H963 129 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 HES4Q9HCC6 221 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 GPR173Q9NS66 373 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.49■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 MPZP25189 248 aa20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 FAM189A2Q15884 450 aa20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 THTPAQ9BU02 230 aa20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 TCF19Q9Y242 345 aa20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CENPV-201ENST00000299736 V9GYS6 101 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms