RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 FA2HQ7L5A8 372 aa10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 OCIAD1Q9NX40 245 aa10.7□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 GPR3P46089 330 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 Q8IYB0 196 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SLC35B3Q9H1N7 401 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 EPPINO95925 133 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 CEACAM6P40199 344 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 CD200P41217 278 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 RAB32Q13637 225 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 IGFBP7Q16270 282 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 C4orf45Q96LM5 186 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PNPP00491 289 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PTGFRP43088 359 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SLC37A1P57057 533 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 GNB2P62879 340 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 CCL7P80098 99 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SLX4Q8IY92 1834 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 HSBP1O75506 76 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 OR2J3O76001 311 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MPC2O95563 127 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 GP1BAP07359 652 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 HMGA2P52926 109 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SLC38A11Q08AI6 406 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TMEM196Q5HYL7 178 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 RAB40CQ96S21 281 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 LRRC61Q9BV99 259 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 HMSDA8MTL9 139 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PPM1DO15297 605 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 DHRS3O75911 302 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ZFPL1O95159 310 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 OR3A4PP47883 348 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 IL13RA2Q14627 380 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ETFDHQ16134 617 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TCTN1Q2MV58 587 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 Q7L0L9 218 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 NAA60Q9H7X0 242 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 WSB1Q9Y6I7 421 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 EVPLQ92817 2033 aa10.69□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ALG1L2C9J202 215 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MASP2O00187 686 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 FAM3AP98173 230 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 FMODQ06828 376 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PDCD1Q15116 288 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PPIL1Q9Y3C6 166 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 STRCQ7RTU9 1775 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SDHBP21912 280 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PRSS54Q6PEW0 395 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ZNF737O75373 536 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PRDX4Q13162 271 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MOB1BQ7L9L4 216 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TMEM37Q8WXS4 190 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 M0R1X1 148 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MVDP53602 400 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 HIST1H3AP68431 136 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 RASL12Q9NYN1 266 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 CLDN34H7C241 214 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 KRASP01116 189 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 CXCL10P02778 98 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 GNG3P63215 75 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 C20orf196Q8IYI0 205 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 AMER3Q8N944 861 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MFRPQ9BY79 579 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ZNF391Q9UJN7 358 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 DOCK2Q92608 1830 aa10.68□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TCAPO15273 167 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 GLULP15104 373 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 RPEL1Q2QD12 228 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 WDR34Q96EX3 536 aa10.67□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ZPBPQ9BS86 351 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms