RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa9.89□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 GABRPO00591 440 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 GPR37O15354 613 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 LANCL1O43813 399 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 GKN3PP0CG01 181 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 THBS4P35443 961 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 HTR5AP47898 357 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 POU3F4P49335 361 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RBP2P50120 134 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CDH12P55289 794 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 EFNB1P98172 346 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 HNF4GQ14541 408 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PDCD1Q15116 288 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PMM1Q92871 262 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 TPD52L3Q96J77 140 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RLIMQ9NVW2 624 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.88□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 OR6C68A6NDL8 312 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 COLCA2A8K830 154 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ALG1L2C9J202 215 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PRODHO43272 600 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 OR2F2O95006 317 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 UTS2O95399 124 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MPIG6BO95866 241 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CRYAAP02489 173 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MT-ND4LP03901 98 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 TFPIP10646 304 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PRPS1P60891 318 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 OR2F1Q13607 317 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MSMPQ1L6U9 139 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CASC10Q5T4H9 136 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 NAA40Q86UY6 237 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 IPPKQ9H8X2 491 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 GHRLQ9UBU3 117 aa9.87□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 UBE2QL1A1L167 161 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 C1orf226A1L170 272 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 GJE1A6NN92 205 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ZNF716A6NP11 495 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SRRM5B3KS81 715 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ZNF879B4DU55 563 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 H0YL77 283 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FGF16O43320 207 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 DHHO43323 396 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 PIP5K1CO60331 668 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 GPANK1O95872 356 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 WNT11O96014 354 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 IGLV1-44P01699 117 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 SBK2P0C263 348 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CECR9P0C854 216 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CDKN2CP42773 168 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MTNR1AP48039 350 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 CRYBA2P53672 197 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 HMGN3Q15651 99 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 KLBQ86Z14 1044 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 OR6X1Q8NH79 312 aa9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HCG18-241ENST00000602290 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms