RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5P3Q8WZ94 311 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2J1Q9GZK6 312 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 RBBP9O75884 186 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 MGMTP16455 207 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CALCRP30988 508 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 KIR2DL3P43628 341 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SRP9P49458 86 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 NAAAQ02083 359 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2T2Q6IF00 324 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 MTFR2Q6P444 385 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 PCSK4Q6UW60 755 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8NFD4 153 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 OR56B1Q8NGI3 324 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SEH1LQ96EE3 360 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 POM121Q96HA1 1249 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 BANF2Q9H503 90 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS2R8Q9NYW2 309 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 KLK11Q9UBX7 282 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PP11 408 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5B21A6NL26 309 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPXA8MT69 81 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf97H3BN30 126 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC6A1P30531 599 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CCKARP32238 428 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 VEGFCP49767 419 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA46Q5T0L3 261 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ENKURQ8TC29 256 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SHANK1Q9Y566 2161 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 NAP1L6A6NFF2 107 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 LILRA1O75019 489 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1D-12P01611 117 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 LPLP06858 475 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 KITLGP21583 273 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 BTCP35070 178 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 BCAP31P51572 246 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ERVS71-1P61550 626 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PSG7Q13046 419 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CDNFQ49AH0 187 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA1AQ53H76 456 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 OLFML2AQ68BL7 652 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM200AQ86VY9 491 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC120Q96HB5 630 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 GAL3ST1Q99999 423 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 NICN1Q9BSH3 213 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 NPAP1Q9NZP6 1156 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 FUOMA2VDF0 154 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR7A2O43488 359 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINA2P20848 420 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF83P51522 516 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM50BP56557 158 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 GUCA2AQ02747 115 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 LY6DQ14210 128 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RSU1Q15404 277 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 OR51T1Q8NGJ9 327 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10K1Q8NGX5 313 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 Q96M66 194 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF732B4DXR9 585 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SOCS1O15524 211 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ANGPTL7O43827 346 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CSF1P09603 554 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2F2P13984 249 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CPT2P23786 658 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MPV17P39210 176 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 GNG3P63215 75 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL6IP1Q15041 203 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF718Q3SXZ3 478 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZTK2 550 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CALHM1Q8IU99 346 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 CHST4Q8NCG5 386 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB3CQ96E17 227 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF170Q96K19 258 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 SELENOIQ9C0D9 397 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 HRASLSQ9HDD0 168 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R1B8 84 aa19.48■□□□□ 0.71
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