RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PP55 124 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC17A3O00476 420 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR32O75388 356 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SOX14O95416 240 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CHRM2P08172 466 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SEC11BP0C7V7 166 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GDF1P27539 372 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SSTR5P35346 364 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC39A11Q8N1S5 342 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TET1Q8NFU7 2136 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR8G5Q8NG78 346 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10C1Q96KK4 312 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 NDC1Q9BTX1 674 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 NGBQ9NPG2 151 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GULP1Q9UBP9 304 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 Q9Y3F1 56 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIP11Q15643 1979 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GTL3 188 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 IFITM5A6NNB3 132 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 H7BYZ3 331 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 J3QR89 54 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 B4GALT2O60909 372 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ALOX12BO75342 701 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CDS2O95674 445 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HAND1O96004 215 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 DANCRP0C864 163 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 JMJD7P0C870 316 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PNMTP11086 282 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CD99P14209 185 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 NID1P14543 1247 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ST6GAL1P15907 406 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CMPK1P30085 196 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 OR1D2P34982 312 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SCAND1P57086 179 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TAS2R41P59536 307 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TAS2R20P59543 309 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 YPEL5P62699 121 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST3H3Q16695 136 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LTC4SQ16873 150 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ARL9Q6T311 187 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF709Q8N972 641 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SMPDL3BQ92485 455 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LMLNQ96KR4 655 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 MFSD1Q9H3U5 465 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC32A1Q9H598 525 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CD207Q9UJ71 328 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 CACNA1BQ00975 2339 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PQU0 124 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HSD17B6O14756 317 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 RAD51DO75771 328 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAPPC6AO75865 159 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP1R3DO95685 299 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 PRH1P02810 166 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 SOAT1P35610 550 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-208ENST00000471759 LTBRP36941 435 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms