RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 NAA40Q86UY6 237 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ACBD4Q8NC06 268 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 CHST4Q8NCG5 386 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 SPSB4Q96A44 273 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 RAB3CQ96E17 227 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 REEP6Q96HR9 211 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 TM2D1Q9BX74 207 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 BEX2Q9BXY8 128 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 HES7Q9BYE0 225 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 KCNK15Q9H427 330 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 OPA3Q9H6K4 179 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 LDAHQ9H6V9 325 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF222Q9UK12 451 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.71□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.71□□□□□ -1.01
POLR1A-204ENST00000424089 MTORP42345 2549 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM235A6NFC5 223 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINE3A8MV23 424 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 E9PLN8 166 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FABP7O15540 132 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MPIG6BO95866 241 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINA5P05154 406 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 DBHP09172 617 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 C4BPBP20851 252 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CPT2P23786 658 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GNG2P59768 71 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 IFITM2Q01629 132 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MPPED2Q15777 294 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2V2Q15819 145 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM42Q69YG0 159 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ASCL4Q6XD76 172 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SOX7Q9BT81 388 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 IFT46Q9NQC8 304 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AKR7A2O43488 359 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ATP6V1G1O75348 118 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RGS11O94810 467 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR2A4O95047 310 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 IGHG3P01860 377 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HPXP02790 462 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AMY2AP04746 511 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RLN1P04808 185 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GSTT2P0CG29 244 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAHP16930 419 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SSTR2P30874 369 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RFC3P40938 356 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RAD52P43351 418 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR3A4PP47883 348 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RBP2P50120 134 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FUT6P51993 359 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RAP2BP61225 183 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR8B8Q15620 311 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR8S1Q8NH09 359 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms