RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS3P35030 304 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CA7P43166 264 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZP1P60852 638 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 Q8NFD4 153 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PIGCQ92535 297 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TM2D1Q9BX74 207 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GPR173Q9NS66 373 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 COPZ2Q9P299 210 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MEMO1Q9Y316 297 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GTF3C1Q12789 2109 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 C16orf97H3BN30 126 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 H7C417 338 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RAB27BO00194 218 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 LYRM1O43325 122 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 LPLP06858 475 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CSF1P09603 554 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CECR9P0C854 216 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CCL2P13500 99 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 KITLGP21583 273 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CPT2P23786 658 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR3A4PP47883 348 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 UQCRFS1P47985 274 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 EFNB2P52799 333 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ACTBP60709 375 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ACTG1P63261 375 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MZT1Q08AG7 82 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PRDX4Q13162 271 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 UNC119Q13432 240 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF573Q86YE8 665 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MKXQ8IYA7 352 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SPERTQ8NA61 448 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 AQP3Q92482 292 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC46Q96FV0 321 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OCEL1Q9H607 264 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TINAGQ9UJW2 476 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ING4Q9UNL4 249 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 HIVEP1P15822 2718 aa8.42□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ORC5O43913 435 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CYB5AP00167 134 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CRYAAP02489 173 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.41□□□□□ -1.06
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