RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 FBLN5Q9UBX5 448 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 C17orf51A8MQB3 221 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FTCDNL1E5RQL4 147 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 DVL1O14640 695 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SLC10A1Q14973 349 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 PLPP5Q8NEB5 264 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SLC22A18Q96BI1 424 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa18.73■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 LINC01553A4QN01 128 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 AMBPP02760 352 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TTRP02766 147 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 VITQ6UXI7 678 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 C1orf87Q8N0U7 546 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 OR5D14Q8NGL3 314 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 GPR87Q9BY21 358 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TWSG1Q9GZX9 223 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 PITPNC1Q9UKF7 332 aa18.72■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZNF823P16415 610 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FUT3P21217 361 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 PCP4P48539 62 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TAS2R46P59540 309 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FOXK1P85037 733 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SULF2Q8IWU5 870 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ZNF700Q9H0M5 742 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FGF22Q9HCT0 170 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 CYP8B1Q9UNU6 501 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 MARCH11A6NNE9 402 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 TNFSF14O43557 240 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 H2BFMP0C1H6 154 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 FMODQ06828 376 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 SP6Q3SY56 376 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 REEP6Q96HR9 211 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 WSB1Q9Y6I7 421 aa18.71■□□□□ 0.59
ODC1-201ENST00000234111 ICAM4Q14773 271 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 CHRFAM7AQ494W8 412 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 OR2G3Q8NGZ4 309 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ZBP1Q9H171 429 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 CBY1Q9Y3M2 126 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 MMACHCQ9Y4U1 282 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 CTSBP07858 339 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 KIR2DS3Q14952 304 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 DMRTC1Q5HYR2 192 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 TMEM183AQ8IXX5 376 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 KCNG3Q8TAE7 436 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 OR10A5Q9H207 317 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 COL4A2P08572 1712 aa18.7■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 HCRTR1O43613 425 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 FAM206AQ9NX38 181 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 DEC1Q9P2X7 70 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 AK3Q9UIJ7 227 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 SCDO00767 359 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 GPR157Q5UAW9 335 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 CCL4L1Q8NHW4 92 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1456Q9P272 454 aa18.69■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ZNF878C9JN71 531 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 PNLIPP16233 465 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 WASP42768 502 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 GPR3P46089 330 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 SLC26A10Q8NG04 563 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PP55 124 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 FZD2Q14332 565 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 SGCBQ16585 318 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 RTN4RQ9BZR6 473 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 PBOV1Q9GZY1 135 aa18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 GNRH1P01148 92 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V0CP27449 155 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 MMP16P51512 607 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 LYZL2Q7Z4W2 148 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 SLC35E3Q7Z769 313 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 GPR137CQ8N3F9 429 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa18.67■□□□□ 0.58
ODC1-201ENST00000234111 OR52M1Q8NGK5 317 aa18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms