RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590619.1

DNMT1-222, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 1 (best)

Gene DNMT1, Length 231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-222	ENST00000590619	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619		M0R135	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	DCTN6	O00399	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	XKRY	O14609	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	OVOL1	O14753	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PSPN	O60542	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	IGHG2	P01859	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SHBG	P04278	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	BPGM	P07738	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	CD14	P08571	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	IFI30	P13284	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	GPX2	P18283	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	CD247	P20963	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PRDX2	P32119	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	DCTD	P32321	178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	CENPA	P49450	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PRR20E	P86478	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PRR20C	P86479	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PRR20D	P86480	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PRR20B	P86481	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PRR20A	P86496	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM3A	P98173	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	IL18R1	Q13478	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SDHD	O14521	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SPAG7	O75391	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ELANE	P08246	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ARSB	P15848	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	GNAL	P38405	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FOXE3	Q13461	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	GPR50	Q13585	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	OAF	Q86UD1	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	RNF170	Q96K19	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SORT1	Q99523	831 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DNMT1-222	ENST00000590619	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms