RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 EML6Q6ZMW3 1958 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF716A6NP11 495 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 E9PLN8 166 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 DHRS3O75911 302 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 VSIG10L2P0DP72 767 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL6IP1Q15041 203 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 NRN1LQ496H8 165 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 DRAM2Q6UX65 266 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 COMMD2Q86X83 199 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 OR11H4Q8NGC9 324 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM45BQ96B21 275 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 VKORC1Q9BQB6 163 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PIPOXQ9P0Z9 390 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 CREBBPQ92793 2442 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PINLYPA6NC86 204 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 G3V3Y1 287 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF735P0CB33 412 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 SELENOPP49908 381 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 SCRN3Q0VDG4 424 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 MCEMP1Q8IX19 187 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM173AQ9BQD7 235 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 EXO5Q9H790 373 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GNT2Q9NY97 397 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 FBN2P35556 2912 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 G3V3Q6 166 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BUI4 141 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PRRG2O14669 202 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 MOGAT2Q3SYC2 334 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 CDNFQ49AH0 187 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTBL2Q562R1 376 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB37Q5TC79 503 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC22Q8N966 263 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4D10Q8NGI6 311 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM57AQ8TBR7 257 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10A2Q9H208 303 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 APCP25054 2843 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 CYTIPO60759 359 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RLN1P04808 185 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 NAT1P18440 290 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CBX5P45973 191 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10K2Q6IF99 312 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 C3P1Q6ZMU1 363 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ACBD4Q8NC06 268 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2M7Q8NG81 312 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2AK2Q8NG84 335 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 LPAR5Q9H1C0 372 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 B4GALT7Q9UBV7 327 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GTF3C1Q12789 2109 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM82A0PJX8 343 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R135 149 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CA11O75493 328 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN14O95500 239 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 AMY2AP04746 511 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYGSP22914 178 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GFRA1P56159 465 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PCBD1P61457 104 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXO1Q12778 655 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 IDO2Q6ZQW0 420 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 BPIFB2Q8N4F0 458 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR56B1Q8NGI3 324 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF799Q96GE5 643 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CST11Q9H112 138 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM38BQ9NVV0 291 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0G2JMM0 328 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPB8 328 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PRS3 328 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM235A6NFC5 223 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 HMSDA8MTL9 139 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KIR3DP1A8MWS1 328 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf84I3L1E1 186 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGER4P35408 488 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RTL6Q6ICC9 239 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 LPCAT3Q6P1A2 487 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 AAED1Q7RTV5 226 aa22.12■■□□□ 1.13
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