RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 DHRS3O75911 302 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV2-5P01817 119 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ISG15P05161 165 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 HTR1AP08908 422 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PRTN3P24158 256 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ACKR3P25106 362 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMB10P40306 273 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLSTN3-212ENST00000541770 MAP2K3P46734 347 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS12P56730 875 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 IL13RA1P78552 427 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SPERTQ8NA61 448 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLSTN3-212ENST00000541770 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 TIMD4Q96H15 378 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GAL3ST1Q99999 423 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 ABCB9Q9NP78 766 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR84Q9NQS5 396 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 DECR2Q9NUI1 292 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 IL19Q9UHD0 177 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 V9GYS6 101 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLSTN3-212ENST00000541770 OMGP23515 440 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CD200P41217 278 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CRYBB2P43320 205 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLSTN3-212ENST00000541770 OR8G1Q15617 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 HFEQ30201 348 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLSTN3-212ENST00000541770 C10orf35Q96D05 121 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLSTN3-212ENST00000541770 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 LRRC42Q9Y546 428 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 CACNG2Q9Y698 323 aa7.3□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1B0GVI7 797 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 E9PI62 339 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 H0YL77 283 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 P2RY10O00398 339 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 MYL12BO14950 172 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 OGG1O15527 345 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 SYT7O43581 403 aa7.29□□□□□ -1.24
CLSTN3-212ENST00000541770 RGS10O43665 173 aa7.29□□□□□ -1.24
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