RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 YPEL4Q96NS1 127 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 DSCR8Q96T75 97 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SLC39A3Q9BRY0 314 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 UBAC1Q9BSL1 405 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ANO3Q9BYT9 981 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 DPEP2Q9H4A9 486 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM134Q9H6X4 195 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ELOVL3Q9HB03 270 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 GPR35Q9HC97 309 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SYTL2Q9HCH5 934 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SHPKQ9UHJ6 478 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SLC13A4Q9UKG4 626 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SLC22A14Q9Y267 594 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 CPQQ9Y646 472 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SNURFQ9Y675 71 aa-2.54□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 GMEB1Q9Y692 573 aa-2.54□□□□□ -2.82
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SNORD54-201ENST00000459159 A0A087WW49 117 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 A0A087X0K7 114 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GUA9 196 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1W2PP18 115 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 C2orf70A6NJV1 201 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 OR5B21A6NL26 309 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 DCDC2CA8MYV0 355 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 E7EUB6 86 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 G3V3Y1 287 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 C15orf65H3BRN8 121 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 F2RL2O00254 374 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP-2.55□□□□□ -2.82
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SNORD54-201ENST00000459159 KPNA6O60684 536 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MPDU1O75352 247 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SH3BGRLO75368 114 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MED6O75586 246 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TRAPPC6AO75865 159 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 CLDN7O95471 211 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV3-11P01762 117 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 P04436 131 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SCTP09683 121 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 CSF3P09919 207 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 IL10P22301 178 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 AHCYP23526 432 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ERP29P30040 261 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 CMPK1P30085 196 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 HTR1FP30939 366 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 OR1E1P30953 314 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ARR3P36575 388 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEA9P43362 315 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 RPS10P46783 165 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 RAB27AP51159 221 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ATP4BP51164 291 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 STAT2P52630 851 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 CRYBA4P53673 196 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PRPS1P60891 318 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 RAB4BP61018 213 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 DAD1P61803 113 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TSPAN5P62079 268 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TBPL1P62380 186 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 CDK5Q00535 292 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SCN7AQ01118 1682 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SGCGQ13326 291 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PDCLQ13371 301 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 RCAN2Q14206 197 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PTPRCAPQ14761 206 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 STXBP2Q15833 593 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MS4A18Q3C1V0 323 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SLC10A6Q3KNW5 377 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 PTPN20Q4JDL3 420 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 KRTCAP3Q53RY4 240 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM225Q6GV28 225 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 GLYATQ6IB77 296 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 OGFOD3Q6PK18 319 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01551Q86U37 167 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 FAM43AQ8N2R8 423 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 ARL14Q8N4G2 192 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 BCORP1Q8N888 145 aa-2.55□□□□□ -2.82
SNORD54-201ENST00000459159 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP-2.55□□□□□ -2.82
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