RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359253.2

CCDC197-201, Transcript of coiled-coil domain containing 197, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC197, Length 1,275 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197-201ENST00000359253 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCDC197-201ENST00000359253 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CCDC197-201ENST00000359253 STARD10Q9Y365 291 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC197-201ENST00000359253 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC197-201ENST00000359253 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 A8MXE2 369 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PRSS44E7EML9 344 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MELTFP08582 738 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 RAC2P15153 192 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 GNLYP22749 145 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 EFNB2P52799 333 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ASCL4Q6XD76 172 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PIGCQ92535 297 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 METTL9Q9H1A3 318 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 GPR173Q9NS66 373 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 IL36GQ9NZH8 169 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CACNG2Q9Y698 323 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CD300LBA8K4G0 201 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 H3BUI4 141 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 H7C417 338 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ORC5O43913 435 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CDC14BO60729 498 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PFDN1O60925 122 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 KDM4BO94953 1096 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CSF1P09603 554 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CCL2P13500 99 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 GDNFP39905 211 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 WNT5AP41221 380 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 OR3A4PP47883 348 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 RFX2P48378 723 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 UCP2P55851 309 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ACTBP60709 375 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ZP1P60852 638 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ACTG1P63261 375 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 DGCR2P98153 550 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 UNC119Q13432 240 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MTFR2Q6P444 385 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PLET1Q6UQ28 207 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MOB3CQ70IA8 216 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 NAXEQ8NCW5 288 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 OR52I2Q8NH67 350 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PRR7Q8TB68 274 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MUCL1Q96DR8 90 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 TM2D1Q9BX74 207 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ING4Q9UNL4 249 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 NBASA2RRP1 2371 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 GTF3C1Q12789 2109 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ESPL1Q14674 2120 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 FUOMA2VDF0 154 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 RAB27BO00194 218 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 AKR7A2O43488 359 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 SMPD2O60906 423 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 NGFP01138 241 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 LPLP06858 475 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CD3GP09693 182 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ZNF35P13682 527 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CPT2P23786 658 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 SLC6A1P30531 599 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CA7P43166 264 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 BCAP31P51572 246 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PPP1CBP62140 327 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 MADCAM1Q13477 382 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PPA1Q15181 289 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 C4orf17Q53FE4 359 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 CLEC18BQ6UXF7 455 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC197-201ENST00000359253 DTX3Q8N9I9 347 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms