RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232888.6

RRP9-201, Transcript of ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRP9, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9-201ENST00000232888 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 A8MXE2 369 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SSX4O60224 188 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 FAM157BP0CG42 384 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 KIR2DL3P43628 341 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PLET1Q6UQ28 207 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 OR56B1Q8NGI3 324 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PPP1R14BQ96C90 147 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 METTL9Q9H1A3 318 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SVILO95425 2214 aa20.49■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ZNF850A8MQ14 1090 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MPIG6BO95866 241 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MELTFP08582 738 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 TMEM225BP0DP42 221 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ZNF35P13682 527 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SELEP16581 610 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SLC6A1P30531 599 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 UCP2P55851 309 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PPP1CBP62140 327 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PRDX4Q13162 271 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 CEACAM21Q3KPI0 293 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SLC22A6Q4U2R8 563 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 TMEM211Q6ICI0 200 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 TMEM104Q8NE00 496 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PXT1Q8NFP0 134 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 OR10R2Q8NGX6 335 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 GPX8Q8TED1 209 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 AQP3Q92482 292 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 POFUT1Q9H488 388 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 COPZ2Q9P299 210 aa20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 A0A0G2JNJ9 132 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 LPLP06858 475 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 RAC2P15153 192 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PLA2G5P39877 138 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 RAD52P43351 418 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SRP9P49458 86 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ACBD4Q8NC06 268 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 OR5D18Q8NGL1 313 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 POM121Q96HA1 1249 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 TM2D1Q9BX74 207 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 IL36GQ9NZH8 169 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 KLK11Q9UBX7 282 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 Q9UFV3 132 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 TINAGQ9UJW2 476 aa20.47■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 CSF1P09603 554 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PRSS12P56730 875 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ACTBP60709 375 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ACTG1P63261 375 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ARL6IP1Q15041 203 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 ZNF260Q3ZCT1 412 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 OR5A2Q8NGI9 324 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MEIOCA2RUB1 952 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 AGFG2O95081 481 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 CECR9P0C854 216 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 VEGFCP49767 419 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 CASP6P55212 293 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PDZK1IP1Q13113 114 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MOGAT2Q3SYC2 334 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 DMRTC1Q5HYR2 192 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MTFR2Q6P444 385 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SSX8Q7RTT4 187 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MUCL1Q96DR8 90 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 SEH1LQ96EE3 360 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 VKORC1Q9BQB6 163 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 DPAGT1Q9H3H5 408 aa20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RRP9-201ENST00000232888 PTHLHP12272 177 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 MGMTP16455 207 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 BMP5P22003 454 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 FAUP35544 74 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 RSU1Q15404 277 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 CDNFQ49AH0 187 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 PLA1AQ53H76 456 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RRP9-201ENST00000232888 GAL3ST1Q99999 423 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms