RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-208ENST00000590422 CENPMQ9NSP4 180 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-208ENST00000590422 KAAG1Q9UBP8 84 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-208ENST00000590422 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CTIF-208ENST00000590422 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ZNF878C9JN71 531 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TBX1O43435 398 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 XRCC2O43543 280 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 NDUFA2O43678 99 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TSPAN15O95858 294 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TFF1P04155 84 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 AMY2BP19961 511 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 CX3CR1P49238 355 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 DAPP51397 102 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 PROK1P58294 105 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 FAM3AP98173 230 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TAF9Q16594 264 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 CDONQ4KMG0 1287 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 WDR82Q6UXN9 313 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 SPERTQ8NA61 448 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 OR8S1Q8NH09 359 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 NRG4Q8WWG1 115 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 AMELYQ99218 206 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 USE1Q9NZ43 259 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 RNF114Q9Y508 228 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 EI24O14681 340 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ALPLP05186 524 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 FMO3P31513 532 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ALDH3A2P51648 485 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A1P53007 311 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 KLRD1Q13241 179 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TAF13Q15543 124 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 MICBQ29980 383 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TEX30Q5JUR7 227 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZSV7 163 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 SGK3Q96BR1 496 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 REEP6Q96HR9 211 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 MMP27Q9H306 513 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 OPA3Q9H6K4 179 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 C8orf4Q9NR00 106 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 KPTNQ9Y664 436 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PRD5 423 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PRF3 423 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PRM7 423 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 FAM183AA6NL82 134 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 M0QZ24 198 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 CLPXO76031 633 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 GMFBP60983 142 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 MZT1Q08AG7 82 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 IKZF1Q13422 519 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TIGD6Q17RP2 521 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 STUMQ69YW2 141 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 FAM57BQ71RH2 274 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 DPY19L4Q7Z388 723 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 PNKDQ8N490 385 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 Q8N7P7 452 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 ABHD6Q9BV23 337 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTIF-208ENST00000590422 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms