RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	GAGE4	Q13068	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SHH	Q15465	462 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM166A	Q6J272	317 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	BEST3	Q8N1M1	668 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OSR2	Q8N2R0	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC35G3	Q8N808	338 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	NAT16	Q8N8M0	369 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	MED28	Q9H204	178 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	RAX	Q9Y2V3	346 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1W2PPV9	198 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	GAGE12B	A1L429	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2W5	A6NFC9	320 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	AGPAT2	O15120	278 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	GHRH	P01286	108 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	CTSB	P07858	339 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	C8orf88	P0DMB2	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ENG	P17813	658 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	HCCS	P53701	268 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	FHL3	Q13643	280 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	KHDC3L	Q587J8	217 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OPN5	Q6U736	354 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	MDS2	Q8NDY4	140 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	BET1L	Q9NYM9	111 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SYNM	O15061	1565 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SERINC4	A6NH21	518 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	COLCA2	A8K830	154 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	HPRT1	P00492	218 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	TIMP1	P01033	207 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS56	P0CW18	603 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	PTH2R	P49190	550 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	STC1	P52823	247 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	AKR1C1	Q04828	323 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA3	Q08378	1498 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	C1orf61	Q13536	156 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	TCTN1	Q2MV58	587 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	CD163	Q86VB7	1156 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	GPD1L	Q8N335	351 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF141	Q8WVD5	230 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SMIM8	Q96KF7	97 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	PRODH2	Q9UF12	536 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A0D9SG52	128 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483		J3KT08	172 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	VCY	O14598	125 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	MAS1	P04201	325 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
CNOT2-231	ENST00000551483	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86

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