RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.47■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 C10orf35Q96D05 121 aa15.47■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 GAL3ST1Q99999 423 aa15.47■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.47■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.47■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.47■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ISPDA4D126 451 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 EFCAB10A6NFE3 127 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 J3QLW9 94 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 IGHV2-5P01817 119 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ISG15P05161 165 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 LIMS3P0CW19 117 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 LIMS4P0CW20 117 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 FAHP16930 419 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF12P17014 697 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF19P17023 458 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CPT2P23786 658 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PSMB10P40306 273 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF154Q13106 437 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MED21Q13503 144 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 WDR86Q86TI4 376 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 LINC01356Q8N9X3 169 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 OR1M1Q8NGA1 313 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 PIGCQ92535 297 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 RNF7Q9UBF6 113 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.46■□□□□ 0.07
COPS7A-216ENST00000543170 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR5B21A6NL26 309 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 B4DSR2 109 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 SYT7O43581 403 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 MYL12AP19105 171 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CFHR2P36980 270 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ZMYND11Q15326 602 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CEACAM21Q3KPI0 293 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM80Q96HE8 168 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM160Q9NX00 188 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FRRS1LQ9P0K9 344 aa15.45■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PPIAL4EA0A075B759 164 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 A6NLC8 198 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PPIAL4DF5H284 164 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 GRPP07492 148 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PPIAL4FP0DN26 164 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TGM4P49221 684 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CSNK2BP67870 215 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FAM166AQ6J272 317 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR5A2Q8NGI9 324 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 GGHQ92820 318 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 C1orf123Q9NWV4 160 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FN1P02751 2386 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FAM157AC9JC47 383 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 NRASP01111 189 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC159P0C7I6 412 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 MYF6P23409 242 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 THBS2P35442 1172 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ETV1P50549 477 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 GNG3P63215 75 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ODF4Q2M2E3 257 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF404Q494X3 552 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC58Q4VC31 144 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 Q71RC1 249 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 OR52N1Q8NH53 320 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 RNF170Q96K19 258 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 TECTBQ96PL2 329 aa15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
COPS7A-216ENST00000543170 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms