RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HNF1A	P20823	631 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MR1	Q95460	341 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RASL10B	Q96S79	203 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	P2RY10	O00398	339 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UBE2C	O00762	179 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC2A1	P11166	492 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ABO	P16442	354 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HOXA6	P31267	233 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GLP1R	P43220	463 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZXDA	P98168	799 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR5B2	Q96R09	309 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LIPT2	A6NK58	231 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTDSPL	O15194	276 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HSPA12A	O43301	675 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CALCB	P10092	127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GTF2F2	P13984	249 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF823	P16415	610 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ID4	P47928	161 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NAXD	Q8IW45	347 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYYR1	Q96J86	154 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BCO1	Q9HAY6	547 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	COLCA2	A8K830	154 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTAG2	O75638	210 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZFAND5	O76080	213 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLDN6	P56747	220 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF616	Q08AN1	781 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRKX	P51817	358 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MICB	Q29980	383 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DDIT4L	Q96D03	193 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRAF2	O60831	178 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IGHM	P01871	453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CRABP1	P29762	137 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ROM1	Q03395	351 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NKD1	Q969G9	470 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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