RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SPANXN5Q5MJ07 72 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR2M3Q8NG83 312 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CD300AQ9UGN4 299 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF141Q15928 474 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PHC2Q8IXK0 858 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 WDR31Q8NA23 367 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 MISP3Q96FF7 219 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 HYLS1Q96M11 299 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 UCN2Q96RP3 112 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 UPK1BO75841 260 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OTOSQ8NHW6 89 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PP6455Q8WZ26 134 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 LRP3O75074 770 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ACP1P24666 158 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CTSSP25774 331 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SSX8Q7RTT4 187 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ADGRG3Q86Y34 549 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 NANOGP1Q8N7R0 232 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PTDSS2Q9BVG9 487 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ADAM19Q9H013 955 aa10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR5H14A6NHG9 310 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR5H1A6NKK0 313 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 HLA-DOBP13765 273 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 BLOC1S1P78537 153 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 TESK1Q15569 626 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 FAM219BQ5XKK7 198 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ACY3Q96HD9 319 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 MED30Q96HR3 178 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 POM121L2Q96KW2 1035 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 TINAGQ9UJW2 476 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 A0A0B4J2A0 478 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 MEIOCA2RUB1 952 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 TMEM235A6NFC5 223 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 FOXS1O43638 330 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CSF2RBP32927 897 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 UBE2G1P62253 170 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF85Q03923 595 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 AVPI1Q5T686 147 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR14K1Q8NGZ2 314 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ABHD17AQ96GS6 310 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 A0A1W2PQD3 144 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ANKRD34CP0C6C1 535 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CEACAM6P40199 344 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 LY6DQ14210 128 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CD226Q15762 336 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR10K2Q6IF99 312 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 LAX1Q8IWV1 398 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 NRG4Q8WWG1 115 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 COA4Q9NYJ1 87 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PSG11Q9UQ72 335 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 TRAPPC4Q9Y296 219 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF320A2RRD8 509 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PTTG1O95997 202 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 CT45A10P0DMU9 189 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 NHLRC1Q6VVB1 395 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF546Q86UE3 836 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 FAM26EQ8N5C1 309 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 FAM181AQ8N9Y4 354 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR13D1Q8NGV5 346 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR2G2Q8NGZ5 317 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SLC25A19Q9HC21 320 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 IAPPP10997 89 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 BPIFB3P59826 476 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 AARDQ4LEZ3 155 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 OR6X1Q8NH79 312 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.75□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 EPPINO95925 133 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SBK3P0C264 359 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF883P0CG24 379 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 ZNF529Q6P280 563 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SYS1Q8N2H4 156 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SLC7A6Q92536 515 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 SPSB1Q96BD6 273 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.74□□□□□ -0.69
NEK1-201ENST00000439128 POFUT1Q9H488 388 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms