RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 FOXJ3Q9UPW0 622 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 STRCQ7RTU9 1775 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 BCORQ6W2J9 1755 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CRYAAP02489 173 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 WNT1P04628 370 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ZBTB25P24278 435 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 DEFB123Q8N688 67 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 OR2M7Q8NG81 312 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 HSPB2A8KAH6 182 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 HSPB2Q16082 182 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 MRGPRX4Q96LA9 322 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 RREB1Q92766 1687 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 PRRG2O14669 202 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ACSM6Q6P461 480 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.18■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 H3BMH7 237 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 TPBGQ13641 420 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SCGB1C2P0DMR2 95 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CALCRP30988 508 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 GUK1Q16774 197 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CAPZBP47756 277 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 POMT2Q9UKY4 750 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 GYPAP02724 150 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 BMP5P22003 454 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 AMTP48728 403 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 FAM162BQ5T6X4 162 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 FA2HQ7L5A8 372 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC190Q86UF4 302 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM37Q8WXS4 190 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 GALR1P47211 349 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ST3GAL2Q16842 350 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.17■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 LIMS3P0CW19 117 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 LIMS4P0CW20 117 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 GNG10P50151 68 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CLDN23Q96B33 292 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 A0A0A6YYD5 115 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 NKG7Q16617 165 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SPINK9Q5DT21 86 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ANKRD53Q8N9V6 530 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 MOB3AQ96BX8 217 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 CXorf58Q96LI9 332 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 PRO1933Q9H354 126 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 TUBAL3A6NHL2 446 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SPRY3O43610 288 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SMIM17P0DL12 118 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 FUT6P51993 359 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 MOB3BQ86TA1 216 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 OR2A1Q8NGT9 310 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 HSBP1O75506 76 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 FFAR4Q5NUL3 377 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF66Q6ZN08 573 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 EXTL1Q92935 676 aa16.16■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 DEFB108AA8MXU0 73 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 RBP4P02753 201 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SULT1A3P0DMM9 295 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SULT1A4P0DMN0 295 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ETFRF1Q6IPR1 90 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 OR2T6Q8NHC8 308 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 KRASP01116 189 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF628Q5EBL2 1059 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 STUMQ69YW2 141 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 FZR1Q9UM11 496 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SLC22A20A6NK97 555 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF785A8K8V0 405 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 DHHO43323 396 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SLC37A1P57057 533 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 ETFDHQ16134 617 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 OR1J1Q8NGS3 322 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.15■□□□□ 0.18
COL5A3-201ENST00000264828 TRAV34A0A0B4J273 112 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.7 ms