RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MELKQ14680 651 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF519Q8TB69 540 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 HHLA2Q9UM44 414 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG1L2C9J202 215 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC6AO75865 159 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TBPP20226 339 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ACHEP22303 614 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPHD2Q6ICH7 369 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPP7Q8NBV4 271 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP6Q8TBB0 222 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF175Q9Y473 711 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB25P24278 435 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFA5Q01523 94 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC10A1Q14973 349 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ATRAIDQ6UW56 229 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2W3Q7Z3T1 314 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFCQ8NFQ6 507 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR7Q8TB68 274 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 STK35Q8TDR2 534 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MITD1Q8WV92 249 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PHB2Q99623 299 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNIPQ9H3M7 391 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PLSCR2Q9NRY7 297 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 NDRG3Q9UGV2 375 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A13Q9Y226 551 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 LUMP51884 338 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF13Q15543 124 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13C8Q8NGS7 320 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R4Q9NYW5 299 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB22AQ9UL26 194 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRK2Q5S007 2527 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQD3 144 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QYG6 137 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PNPP00491 289 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CRABP1P29762 137 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 GSK3AP49840 483 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM8P78325 824 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf107Q6ZR85 190 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP3Q92482 292 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OSGIN2Q9Y236 505 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 R4GMQ9 66 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF222A6NCQ9 220 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SPARCP09486 303 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS27P42677 84 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTCAP3Q53RY4 240 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf46Q6UWT4 87 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SVBPQ8N300 66 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2M3Q8NG83 312 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52N5Q8NH56 324 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 STOML3Q8TAV4 291 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF524Q96C55 264 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR3Q9UBC9 169 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG12O94817 140 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKXP51817 358 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 DEGS2Q6QHC5 323 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00518Q8N0U6 118 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 FADS6Q8N9I5 356 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM185AQ8NFB2 350 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A7Q99884 636 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CBR3O75828 277 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 WISP1O95388 367 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHG3P01860 377 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKACAP17612 351 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PGCP20142 388 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 NAAAQ02083 359 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 GLO1Q04760 184 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ACKR1Q16570 336 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM244Q5VVB8 128 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35D2Q76EJ3 337 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD6Q9BV23 337 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK15Q9H427 330 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP12Q9Y561 859 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ZIC3O60481 467 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A7O60669 478 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 ELP2Q6IA86 826 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OR13C3Q8NGS6 347 aa23.09■■□□□ 1.29
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