RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 SPSB2Q99619 263 aa11.06□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SOX7Q9BT81 388 aa11.06□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.06□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 WNT16Q9UBV4 365 aa11.06□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PARP14Q460N5 1801 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SHOXO15266 292 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 IFNA17P01571 189 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 CXCL10P02778 98 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF728P0DKX0 622 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 BCKDHBP21953 392 aa11.05□□□□□ -0.64
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TRIOBP-211ENST00000492485 PCK2Q16822 640 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM240Q5SV17 173 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SSX9Q7RTT3 188 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 TERB2Q8NHR7 220 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0G2JK05 382 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PLSCR5A0PG75 271 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 OGG1O15527 345 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2J2O76002 312 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 CT45A8P0DMV1 189 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 CT45A9P0DMV2 189 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 OR5H8P0DN80 308 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 FOXK1P85037 733 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 MRI1Q9BV20 369 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 VSIG4Q9Y279 399 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SPEGQ15772 3267 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 YIF1AO95070 293 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3-13P01766 116 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV3-7P01780 117 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 FABP1P07148 127 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 IAPPP10997 89 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 G0S2P27469 103 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 STPG1Q5TH74 334 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC22A25Q6T423 547 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 THRSPQ92748 146 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 LYRM4Q9HD34 91 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.05□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 CD37P11049 281 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 ABCD3P28288 659 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC6A8P48029 635 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF84P51523 738 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 MIOXQ9UGB7 285 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 IFNA2P01563 188 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PLGLB1Q02325 96 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PLXDC1Q8IUK5 500 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 POM121Q96HA1 1249 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 TOX2Q96NM4 488 aa11.04□□□□□ -0.64
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TRIOBP-211ENST00000492485 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PADI1Q9ULC6 663 aa11.04□□□□□ -0.64
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TRIOBP-211ENST00000492485 TAS2R31P59538 309 aa11.04□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
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TRIOBP-211ENST00000492485 SYT3Q9BQG1 590 aa11.04□□□□□ -0.64
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TRIOBP-211ENST00000492485 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.03□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.03□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 ASB5Q8WWX0 329 aa11.03□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa11.03□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.03□□□□□ -0.64
TRIOBP-211ENST00000492485 KLK13Q9UKR3 277 aa11.03□□□□□ -0.64
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