RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486827.1

RAD51C-210, Transcript of RAD51 paralog C, humanhuman

TSL 2

Gene RAD51C, Length 1,609 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51C-210ENST00000486827 ENKURQ8TC29 256 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 YIPF5Q969M3 257 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 HDHD2Q9H0R4 259 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ABCG5Q9H222 651 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 OR52A1Q9UKL2 312 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ETV7Q9Y603 341 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 A0A0B4J293 547 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 A0A1W2PPL8 197 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 MEIOCA2RUB1 952 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 H3BSH0 61 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CD37P11049 281 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 FSTP19883 344 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ACHEP22303 614 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 DCTDP32321 178 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ZNF83P51522 516 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CLDN12P56749 244 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CLDN17P56750 224 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 PITPNAQ00169 270 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 GPR176Q14439 515 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SLC36A2Q495M3 483 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CARD17Q5XLA6 110 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 TMEM54Q969K7 222 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 RNF121Q9H920 327 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 EMC7Q9NPA0 242 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 FAM206AQ9NX38 181 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 UPB1Q9UBR1 384 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 DHDHQ9UQ10 334 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.49□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 PLCE1Q9P212 2302 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ZNF726A6NNF4 738 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ABCD4O14678 606 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SMPD2O60906 423 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 VAMP5O95183 116 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 MAS1P04201 325 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CD3EP07766 207 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 H2BFMP0C1H6 154 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 DANCRP0C864 163 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 MNDAP41218 407 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 INPP1P49441 399 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 MMP16P51512 607 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SCAND1P57086 179 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 DGCR2P98153 550 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 Q5PR19 223 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 FAM166AQ6J272 317 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ZNF611Q8N823 705 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 NELFAQ9H3P2 528 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 C1orf198Q9H425 327 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 EDARQ9UNE0 448 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 FOXJ3Q9UPW0 622 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.48□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ANXA2P2A6NMY6 339 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 QDPRP09417 244 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CDAP32320 146 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 BTCP35070 178 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 DDOSTP39656 456 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 PTH2RP49190 550 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 PLA1AQ53H76 456 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 C10orf128Q5T292 105 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 TMEM123Q8N131 208 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 PIGTQ969N2 578 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 HAVCR1Q96D42 359 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 OR2M2Q96R28 347 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 CENPMQ9NSP4 180 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 GLTPQ9NZD2 209 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 NLKQ9UBE8 527 aa11.47□□□□□ -0.57
RAD51C-210ENST00000486827 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms