RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GPR84Q9NQS5 396 aa25.36■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 P2RY10O00398 339 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 OR4A8P0C604 315 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC2LP0C7M8 214 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF250P15622 560 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 GCH1P30793 250 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF787Q6DD87 383 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 RDH10Q8IZV5 341 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 SYNPRQ8TBG9 265 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 FBXW5Q969U6 566 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 DUSP13Q9UII6 198 aa25.35■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 HS3ST1O14792 307 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 PIN1P1O15428 100 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV3-1P01715 115 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 MOGQ16653 247 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 LRP11Q86VZ4 500 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 AP3S1Q92572 193 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 SOX7Q9BT81 388 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 CELSR2Q9HCU4 2923 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF391Q9UJN7 358 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 VSTM5A8MXK1 200 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 RAC2P15153 192 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 OR51A4Q8NGJ6 313 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 OR10AC1Q8NH08 325 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 SYT3Q9BQG1 590 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 UBTD1Q9HAC8 227 aa25.34■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 H3BSH0 61 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 SRMP19623 302 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINF1P36955 418 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 FAM3AP98173 230 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 PSG7Q13046 419 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM255AQ5JRV8 349 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM106AQ96A25 262 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 HAVCR1Q96D42 359 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 OPA3Q9H6K4 179 aa25.33■■□□□ 1.65
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GTI1 187 aa25.32■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa25.32■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 CD2P06729 351 aa25.32■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 PLK3Q9H4B4 646 aa25.32■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 DHDHQ9UQ10 334 aa25.32■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa25.31■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 RAB3BP20337 219 aa25.31■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 OR2T2Q6IF00 324 aa25.31■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 SLITRK2Q9H156 845 aa25.31■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa25.31■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 PEX16Q9Y5Y5 336 aa25.31■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GVI7 797 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PPK0 400 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 PDCD5O14737 125 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 INHBBP09529 407 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 CCL1P22362 96 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 SSTR2P30874 369 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 SOX2P48431 317 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 GSK3AP49840 483 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 SELENOVP59797 346 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 ZFAND2BQ8WV99 257 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 GGT3PA6NGU5 568 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 SYT7O43581 403 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM127O75204 238 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-13P01766 116 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEB1P43366 347 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 ALKBH6Q3KRA9 238 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL14Q8N1E6 418 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 MUC15Q8N387 334 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 PLPP7Q8NBV4 271 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 S100ZQ8WXG8 99 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 TCF7L1Q9HCS4 588 aa25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD61A6NGH8 418 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 KITLGP21583 273 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 BMXP51813 675 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 TNK1Q13470 666 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 DOK3Q7L591 496 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 NR2C2APQ86WQ0 139 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF611Q8N823 705 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 BHLHE23Q8NDY6 225 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC54Q8NEL0 328 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 FAIMQ9NVQ4 179 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 CENPEQ02224 2701 aa25.29■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JK05 382 aa25.28■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 CD300LBA8K4G0 201 aa25.28■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF12P17014 697 aa25.28■■□□□ 1.64
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