RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 CEBPBP17676 345 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 SSX1Q16384 188 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 HPP00738 406 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 EPHA2P29317 976 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PI4KAP42356 2102 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DSCR3O14972 297 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 BTG2P78543 158 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8G1Q15617 311 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 VWA1Q6PCB0 445 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 HSD17B8Q92506 261 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DCTDP32321 178 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PPOXP50336 477 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 STARD5Q9NSY2 213 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TBX21Q9UL17 535 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 SLCO2B1O94956 709 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ST6GAL1P15907 406 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DRAM2Q6UX65 266 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GALMQ96C23 342 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 R4GMQ9 66 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MFNGO00587 321 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GJB5O95377 273 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 F13BP05160 661 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGFRP43088 359 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP5Q16690 384 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00303Q3SY05 128 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 KHDC3LQ587J8 217 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR34Q96EX3 536 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PERPQ96FX8 193 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0U1RQS6 177 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 FGF2P09038 288 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 NTSR1P30989 418 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF273Q14593 569 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 FDX2Q6P4F2 183 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR3A1P47881 315 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 Q7L0L9 218 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 NHLH1Q02575 133 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 NHLH2Q02577 135 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP8Q13202 625 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LIPHQ8WWY8 451 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 GABRQQ9UN88 632 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 DIO1P49895 249 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 SSX8Q7RTT4 187 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 TP53RKQ96S44 253 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 STRCQ7RTU9 1775 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 SOCS7O14512 581 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 TEAD1P28347 426 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 S1PR5Q9H228 398 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 CA10Q9NS85 328 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8B8Q15620 311 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 APCDD1Q8J025 514 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms