RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 MPNDQ8N594 471 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 MYH7P12883 1935 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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CTU2-204ENST00000564105 XAGE2Q96GT9 111 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 GGA1Q9UJY5 639 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 MX1P20591 662 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 ADORA1P30542 326 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 UFL1O94874 794 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 BCS1LQ9Y276 419 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 SNED1Q8TER0 1413 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 SBF1O95248 1867 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 GORABQ5T7V8 394 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 GPATCH3Q96I76 525 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 C6orf229H3BNL8 230 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 PDE1AP54750 535 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 C1QTNF8P60827 252 aa23.46■■□□□ 1.35
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CTU2-204ENST00000564105 SOGA3Q5TF21 947 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 POLLQ9UGP5 575 aa23.46■■□□□ 1.35
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CTU2-204ENST00000564105 STAP2Q9UGK3 403 aa23.45■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.45■■□□□ 1.34
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CTU2-204ENST00000564105 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 KLRK1P26718 216 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.44■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 PSME4Q14997 1843 aa23.43■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 AOX1Q06278 1338 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 MED23Q9ULK4 1368 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 GYG1P46976 350 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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CTU2-204ENST00000564105 PHKA1P46020 1223 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 BCAMP50895 628 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 CCDC102BQ68D86 513 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.41■■□□□ 1.34
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CTU2-204ENST00000564105 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 DOCK2Q92608 1830 aa23.41■■□□□ 1.34
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CTU2-204ENST00000564105 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 CEP350Q5VT06 3117 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 ATP5JP18859 108 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 VPS37DQ86XT2 251 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 PSMD1Q99460 953 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-204ENST00000564105 RIMBP2O15034 1052 aa23.39■■□□□ 1.33
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CTU2-204ENST00000564105 WASHC4Q2M389 1173 aa23.39■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.39■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 TTC22Q5TAA0 569 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
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CTU2-204ENST00000564105 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
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CTU2-204ENST00000564105 MCAMP43121 646 aa23.35■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.35■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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CTU2-204ENST00000564105 CD209Q9NNX6 404 aa23.34■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 NFKBIEO00221 500 aa23.33■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 PPIP5K2O43314 1243 aa23.33■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.33■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 AOC3Q16853 763 aa23.33■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 HAUS7Q99871 368 aa23.33■■□□□ 1.33
CTU2-204ENST00000564105 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.32■■□□□ 1.32
CTU2-204ENST00000564105 G3V3G9 751 aa23.32■■□□□ 1.32
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