RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.15■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 DPF2Q92785 391 aa26.15■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 COPRSQ9NQ92 184 aa26.15■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.15■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 PDE8BO95263 885 aa26.14■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 SCNN1DP51172 638 aa26.14■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.14■■□□□ 1.78
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP17L3A6NCW0 530 aa26.13■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP17L4A6NCW7 530 aa26.13■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.13■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.13■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.13■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.13■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 H7C1D1 291 aa26.12■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 SIL1Q9H173 461 aa26.12■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.12■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNAP23O00161 211 aa26.11■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 CD209Q9NNX6 404 aa26.11■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 EPS15P42566 896 aa26.1■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATP8B2P98198 1209 aa26.1■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.1■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 LDHDQ86WU2 507 aa26.1■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.1■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.1■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 KLRK1P26718 216 aa26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 COG6Q9Y2V7 657 aa26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.09■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.08■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHADLQ6NUI6 762 aa26.08■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 VPS37DQ86XT2 251 aa26.08■■□□□ 1.77
ADAMTS17-205ENST00000558960 IL1R1P14778 569 aa26.07■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 LPIN2Q92539 896 aa26.07■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBXW7Q969H0 707 aa26.07■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.07■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.06■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC5A1P13866 664 aa26.06■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 MMP14P50281 582 aa26.06■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 MICALL2Q8IY33 904 aa26.05■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 SSH3Q8TE77 659 aa26.05■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.05■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 A0A1B0GUL6 1792 aa26.05■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 FGFR2P21802 821 aa26.04■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 GTF2IP78347 998 aa26.04■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.04■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 SASH1O94885 1247 aa26.03■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 GYG1P46976 350 aa26.03■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 POLA2Q14181 598 aa26.03■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 DACT2Q5SW24 774 aa26.03■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.03■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF609O15014 1411 aa26.03■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 POTEIP0CG38 1075 aa26.02■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 POTEJP0CG39 1038 aa26.02■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATP2B3Q16720 1220 aa26.02■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 OGFOD1Q8N543 542 aa26.02■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.02■■□□□ 1.76
ADAMTS17-205ENST00000558960 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP17L8P0C7I0 530 aa26.01■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 SCN9AQ15858 1988 aa26.01■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 GMLQ99445 158 aa26.01■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 HSPA6P17066 643 aa26■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 CEP85Q6P2H3 762 aa26■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 PSME4Q14997 1843 aa25.98■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.98■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 HMMRO75330 724 aa25.98■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 TFCP2Q12800 502 aa25.98■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 BCAMP50895 628 aa25.97■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.97■■□□□ 1.75
ADAMTS17-205ENST00000558960 CNTROBQ8N137 903 aa25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms