RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547329.1

LRIG3-204, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3, human

TSL 3

Gene LRIG3, Length 560 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRIG3-204	ENST00000547329	GRAP	Q13588	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	CTSW	P56202	376 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	GREM2	Q9H772	168 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	PDE8A	O60658	829 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	FOXO4	P98177	505 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	PSMD1	Q99460	953 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.4	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
LRIG3-204	ENST00000547329	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ALDH1B1	P30837	517 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		10.39	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	UTY	O14607	1347 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	PTPRC	P08575	1304 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	BCAR3	O75815	825 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	CSF1R	P07333	972 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	GPSM2	P81274	684 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SUCLG2	Q96I99	432 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10.38	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	FZD9	O00144	591 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	AOC3	Q16853	763 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SOGA3	Q5TF21	947 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	GRM8	O00222	908 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	KLRK1	P26718	216 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		10.36	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SNAP23	O00161	211 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	BBOX1	O75936	387 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	TRIM27	P14373	513 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.35	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SHTN1	A0MZ66	631 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	RLBP1	P12271	317 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ITGA6	P23229	1130 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LRIG3-204	ENST00000547329	FOXN1	O15353	648 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	PPIP5K2	O43314	1243 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	SCNN1D	P51172	638 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	MPND	Q8N594	471 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	MEIS3	Q99687	375 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	ARHGAP33	O14559	1287 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LRIG3-204	ENST00000547329	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.32	□□□□□ -0.76

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