RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 MUC3BQ9H195 1237 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.77□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 CDC27P30260 824 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 EDEM1Q92611 657 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.76□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 F8W735 103 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 C8orf34Q49A92 452 aa8.75□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.75□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.75□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 TTC16Q8NEE8 873 aa8.75□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 CNTN3Q9P232 1028 aa8.75□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 FAM13AO94988 1023 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 KIF4AO95239 1232 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 GLB1P16278 677 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 PCSK2P16519 638 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 ARTNQ5T4W7 220 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 PBX4Q9BYU1 374 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.74□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 FAM177BA6PVY3 158 aa8.73□□□□□ -1.01
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TRDN-204ENST00000542443 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.73□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.73□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 CEP120Q8N960 986 aa8.73□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.73□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 A6NHS1 94 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 PTPRAP18433 802 aa8.72□□□□□ -1.01
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TRDN-204ENST00000542443 AAMPQ13685 434 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.72□□□□□ -1.01
TRDN-204ENST00000542443 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.72□□□□□ -1.01
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TRDN-204ENST00000542443 CES1P23141 567 aa8.71□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 CCDC27Q2M243 656 aa8.71□□□□□ -1.02
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TRDN-204ENST00000542443 WISP1O95388 367 aa8.7□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 ACPPP15309 386 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRDN-204ENST00000542443 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 XKR5Q6UX68 686 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 POLIQ9UNA4 740 aa8.69□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 CABP4P57796 275 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZS46 218 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 ADAM19Q9H013 955 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.67□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 FZD6O60353 706 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 FSTP19883 344 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 HHIPQ96QV1 700 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.66□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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TRDN-204ENST00000542443 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.65□□□□□ -1.02
TRDN-204ENST00000542443 H3BRJ5 948 aa8.64□□□□□ -1.03
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TRDN-204ENST00000542443 TM4SF5O14894 197 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 ADAM11O75078 769 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 CEP41Q9BYV8 373 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 RNF112Q9ULX5 631 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 RAXQ9Y2V3 346 aa8.64□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 EREGO14944 169 aa8.63□□□□□ -1.03
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