RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531500.5

RBM25-209, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 3

Gene RBM25, Length 1,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-209	ENST00000531500	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	POTEC	B2RU33	542 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	PSMD14	O00487	310 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	KLRK1	P26718	216 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	TOMM70	O94826	608 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	EPHX2	P34913	555 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SLC5A1	P13866	664 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	GYG1	P46976	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SCNN1D	P51172	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	POLA2	Q14181	598 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	LPIN2	Q92539	896 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500		H7C1D1	291 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	EPS15	P42566	896 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	GTF2I	P78347	998 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	DPF2	Q92785	391 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	HMMR	O75330	724 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	IL1R1	P14778	569 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	FGFR2	P21802	821 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	TFCP2	Q12800	502 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SASH1	O94885	1247 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	BCAM	P50895	628 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	TIMM10	P62072	90 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500		A0A1B0GUL7	405 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	FSTL1	Q12841	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM25-209	ENST00000531500	SCN4A	P35499	1836 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RBM25-209	ENST00000531500	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM25-209	ENST00000531500	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM25-209	ENST00000531500	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM25-209	ENST00000531500	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM25-209	ENST00000531500	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM25-209	ENST00000531500	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM25-209	ENST00000531500	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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