RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP9-201ENST00000417027 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP9-201ENST00000417027 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.65□□□□□ -1.34
RPS3AP9-201ENST00000417027 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ALX3O95076 343 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTC16Q8NEE8 873 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 MUC3BQ9H195 1237 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 USP35Q9P2H5 1018 aa6.64□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP11AP98196 1134 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 C8orf34Q49A92 452 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CNTN3Q9P232 1028 aa6.63□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 DLL1O00548 723 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ABL1P00519 1130 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 AAMPQ13685 434 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CEP120Q8N960 986 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 POLIQ9UNA4 740 aa6.62□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 USP5P45974 858 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARTNQ5T4W7 220 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CEP135Q66GS9 1140 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 PMEPA1Q969W9 287 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 PBX4Q9BYU1 374 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPME1Q9Y570 386 aa6.61□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 A6NHS1 94 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 FZD6O60353 706 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CES1P23141 567 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDC27P30260 824 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDC25BP30305 580 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 EHHADHQ08426 723 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 SETDB1Q15047 1291 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 CHRDQ9H2X0 955 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.6□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RPS3AP9-201ENST00000417027 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.59□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 F8W735 103 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 ICMTO60725 284 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTPRAP18433 802 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 NBPF11Q86T75 865 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 GJD3Q8N144 294 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 GIPC2Q8TF65 315 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADAM19Q9H013 955 aa6.58□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 LINC01387J3KSC0 135 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 PHACTR2O75167 634 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNFRSF21O75509 655 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 WISP1O95388 367 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 GLB1P16278 677 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.57□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 H3BRB1 525 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERCC3P19447 782 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 EPHA1P21709 976 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 CABP4P57796 275 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRP8Q14114 963 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 CEP41Q9BYV8 373 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.56□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 NFKBIEO00221 500 aa6.55□□□□□ -1.36
RPS3AP9-201ENST00000417027 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms