RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD1	O00168	92 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	INPP4B	O15327	924 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZW10	O43264	779 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFSF12	O43508	249 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO1D	O94832	1006 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	LYPD3	O95274	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IL6	P05231	212 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NPR2	P20594	1047 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HTR1E	P28566	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP12A	P54707	1039 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	AP1S2	P56377	157 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NRF1	Q16656	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DGUOK	Q16854	277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2H4	Q92759	462 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HBEGF	Q99075	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CGREF1	Q99674	301 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SPEG	Q15772	3267 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.09	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	GOSR2	O14653	212 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TOR1A	O14656	332 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SNAI2	O43623	268 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PDYN	P01213	254 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RPN2	P04844	631 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT2	P09544	360 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A3	P33764	101 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	LIM2	P55344	173 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PFN3	P60673	137 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PAX2	Q02962	417 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	UTF1	Q5T230	341 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	LIX1	Q8N485	282 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	UFD1	Q92890	307 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52E6	Q96RD3	313 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CIB1	Q99828	191 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.09	□□□□□ -1.76

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