RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SLC2A1	P11166	492 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF823	P16415	610 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KITLG	P21583	273 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ANOS1	P23352	680 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OMG	P23515	440 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GSTT1	P30711	240 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC25A1	P53007	311 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RAD23A	P54725	363 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RAG2	P55895	527 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ESRRG	P62508	458 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GNB2	P62879	340 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZMYND11	Q15326	602 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TAF9	Q16594	264 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FBLN7	Q53RD9	439 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SPRN	Q5BIV9	151 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688		Q6YL49	198 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CYGB	Q8WWM9	190 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DYRK2	Q92630	601 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PTP4A1	Q93096	173 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HAVCR1	Q96D42	359 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MAP6	Q96JE9	813 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	AMELY	Q99218	206 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PITX2	Q99697	317 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TEX12	Q9BXU0	123 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CENPM	Q9NSP4	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	USE1	Q9NZ43	259 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C1RL	Q9NZP8	487 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C5orf63	A6NC05	138 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	LRRC30	A6NM36	301 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688		F5H5K5	113 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688		J3QW42	95 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DLGAP1	O14490	977 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	AHCYL1	O43865	530 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GLCE	O94923	617 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ATP6V1G2	O95670	118 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ABHD16A	O95870	558 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RAC2	P15153	192 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SELE	P16581	610 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC2A5	P22732	501 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FMO3	P31513	532 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GGT2	P36268	569 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ENTPD1	P49961	510 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PRKX	P51817	358 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	AQP4	P55087	323 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IL5RA	Q01344	420 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC34A1	Q06495	639 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	AQP6	Q13520	282 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GPR157	Q5UAW9	335 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NAA40	Q86UY6	237 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KLB	Q86Z14	1044 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TMEM163	Q8TC26	289 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49

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