RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	RGCC	Q9H4X1	137 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404		A8MXK9	166 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC2A5	P22732	501 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	CPT2	P23786	658 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PITPNB	P48739	271 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	OR8B8	Q15620	311 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	KCNJ8	Q15842	424 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF404	Q494X3	552 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	COMMD2	Q86X83	199 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	LRP12	Q9Y561	859 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404		M0R129	80 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PRKY	O43930	277 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	GRP	P07492	148 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	CD80	P33681	288 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PMEL	P40967	661 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	GSK3A	P49840	483 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM3A	P98173	230 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	MPPED2	Q15777	294 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	MRO	Q9BYG7	248 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	CLN8	Q9UBY8	286 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	CCDC182	A6NF36	153 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	FSTL3	O95633	263 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	AVP	P01185	164 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	IL5RA	Q01344	420 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF154	Q13106	437 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	CIB1	Q99828	191 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	MICU1	Q9BPX6	476 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ABCB9	Q9NP78	766 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	MMP26	Q9NRE1	261 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	STAB1	Q9NY15	2570 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ZAR1L	A6NP61	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	LGALS8	O00214	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PSMD9	O00233	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PHYH	O14832	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	WNT2	P09544	360 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF12	P17014	697 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	ALOX5AP	P20292	161 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CHMP3-208	ENST00000486404	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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