RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 PSMB10P40306 273 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 FAM3AP98173 230 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 FAM57BQ71RH2 274 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 PRSS45Q7RTY3 260 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 CPOQ8IVL8 374 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 FTMTQ8N4E7 242 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 OR8S1Q8NH09 359 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 THEM6Q8WUY1 208 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 C1orf123Q9NWV4 160 aa12.9□□□□□ -0.34
NISCH-205ENST00000467594 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 A6NLC8 198 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 GSC2O15499 205 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 TIPRLO75663 272 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 RASSF2P50749 326 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 TUSC1Q2TAM9 212 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 KLHL12Q53G59 568 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 CD276Q5ZPR3 534 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 C22orf15Q8WYQ4 148 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 UPRTQ96BW1 309 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 PGAM5Q96HS1 289 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 AMELYQ99218 206 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 NIPAL2Q9H841 368 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ERVK-18Q9QC07 812 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 STAB1Q9NY15 2570 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa12.89□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 TMEM89A2RUT3 159 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 OOEPA6NGQ2 149 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 SELENOFO60613 162 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 GNALP38405 381 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 GSK3AP49840 483 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 RPS7P62081 194 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 BNIP1Q12981 228 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 OR8B8Q15620 311 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZNF841Q6ZN19 808 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 DOK3Q7L591 496 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 PARP8Q8N3A8 854 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZDHHC22Q8N966 263 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 C19orf18Q8NEA5 215 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ABCB9Q9NP78 766 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 BRD7Q9NPI1 651 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZNF69Q9UC07 566 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ZNF391Q9UJN7 358 aa12.88□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ATP5HO75947 161 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 LIPFP07098 398 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 SLC2A5P22732 501 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 MTNR1AP48039 350 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 CRISP1P54107 249 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 IL5RAQ01344 420 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 SNAPC1Q16533 368 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 C11orf91Q3C1V1 193 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 FAHD1Q6P587 224 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 OR5K1Q8NHB7 308 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ITFG2Q969R8 447 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 PRRG3Q9BZD7 231 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 YIPF3Q9GZM5 350 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ESM1Q9NQ30 184 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 LAMP5Q9UJQ1 280 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.87□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ANXA2P2A6NMY6 339 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 C3orf80F5H4A9 247 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ADAM20O43506 726 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 LHBP01229 141 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ALOX5APP20292 161 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 BPIFB3P59826 476 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 ESRRGP62508 458 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 APOFQ13790 326 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 GFOD2Q3B7J2 385 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 LCN1P1Q5VSP4 162 aa12.86□□□□□ -0.35
NISCH-205ENST00000467594 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms