RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4C12Q96R67 309 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 H0YIV9 168 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 M0R3E3 92 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ACOT8O14734 319 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 MGMTP16455 207 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR1D5P58170 312 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 HERVK_113P61574 105 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 IHHQ14623 411 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP6V1FQ16864 119 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PRR14Q9BWN1 585 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 GSX2Q9BZM3 304 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GALT3O60512 393 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RPEL1Q2QD12 228 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CLLU1Q5K131 121 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ARNTLO00327 626 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR10C1Q96KK4 312 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CA3P07451 260 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 AGBL4Q5VU57 503 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 USP22Q9UPT9 525 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SFTA3P0C7M3 94 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDX4Q13162 271 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR52N5Q8NH56 324 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CSF3RQ99062 836 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RHOFQ9HBH0 211 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PIGAP37287 484 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 MIDNQ504T8 468 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PET117Q6UWS5 81 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 NPEPL1Q8NDH3 523 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 IL22RA2Q969J5 263 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 EDEM2Q9BV94 578 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 EXTL1Q92935 676 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 H3BP45 60 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 FCN1O00602 326 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL29P47914 159 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 INHBCP55103 352 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TCEAL1Q15170 157 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF260Q3ZCT1 412 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 GPX8Q8TED1 209 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ATG101Q9BSB4 218 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC15Q8TF66 581 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 NEURL3Q96EH8 262 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A13Q96H72 371 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 Q96M85 177 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4C46A6NHA9 309 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CTSCP53634 463 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 WBP2Q969T9 261 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 MS4A10Q96PG2 267 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CALHM3Q86XJ0 350 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 HAAOP46952 286 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2A2Q6IF42 318 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR84Q9NQS5 396 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CRISP2P16562 243 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 PLA1AQ53H76 456 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4S1Q8NGB4 309 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF749O43361 778 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 ALX3O95076 343 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TRILQ7L0X0 811 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CMTM4Q8IZR5 234 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 TNFRSF19Q9NS68 423 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 DHODHQ02127 395 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 CLN3Q13286 438 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRJ-207ENST00000613246 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms