RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555894.5

TTC7B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 3

Gene TTC7B, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF12	P17014	697 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ANOS1	P23352	680 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	CPT2	P23786	658 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	GSTT1	P30711	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PMEL	P40967	661 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	CX3CR1	P49238	355 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	GNB2	P62879	340 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ACTG1	P63261	375 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF404	Q494X3	552 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	FAM201A	Q5SY85	155 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	KLB	Q86Z14	1044 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894		Q8TCH9	128 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	OR8B2	Q96RD0	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	TOR3A	Q9H497	397 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	YY1AP1	Q9H869	796 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	C5orf63	A6NC05	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	GLCE	O94923	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	FSTL3	O95633	263 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	FSHB	P01225	129 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	MPPED2	Q15777	294 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	TIGD6	Q17RP2	521 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ASRGL1	Q7L266	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	SHF	Q7M4L6	423 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	SP140L	Q9H930	580 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	EBAG9	O00559	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	APOC1	P02654	83 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PITPNB	P48739	271 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	GINS1	Q14691	196 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	SPERT	Q8NA61	448 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ABHD6	Q9BV23	337 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	TEX12	Q9BXU0	123 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	RNF7	Q9UBF6	113 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	CLN8	Q9UBY8	286 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	NUP50	Q9UKX7	468 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894		A6NLC8	198 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	FKBP6	O75344	327 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	HMGN1	P05114	100 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	H2BFM	P0C1H6	154 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	OSM	P13725	252 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	ANXA8	P13928	327 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PRKACG	P22612	351 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	DDOST	P39656	456 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	MZT1	Q08AG7	82 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	FAM57B	Q71RH2	274 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	TIGD4	Q8IY51	512 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	REEP6	Q96HR9	211 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	MARCH7	Q9H992	704 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	NTN4	Q9HB63	628 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTC7B-208	ENST00000555894	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	PRODH	O43272	600 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	GRP	P07492	148 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	LYN	P07948	512 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	CD80	P33681	288 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	PAX8	Q06710	450 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTC7B-208	ENST00000555894	OR8B8	Q15620	311 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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