RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF175	Q9Y473	711 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508		A6NIN4	97 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	P2RY10	O00398	339 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CTDSPL	O15194	276 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CLDN14	O95500	239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	TTR	P02766	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ACSM4	P0C7M7	580 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CLDN12	P56749	244 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	AAED1	Q7RTV5	226 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ABHD3	Q8WU67	409 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	MEGF11	A6BM72	1044 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	RER1	O15258	196 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CD37	P11049	281 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CTSS	P25774	331 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	COL8A1	P27658	744 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	MMP15	P51511	669 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST1H3A	P68431	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB11B	Q15907	218 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	GJC3	Q8NFK1	279 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM45B	Q96B21	275 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC17A2	O00624	439 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	LYRM1	O43325	122 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	TNFSF13	O75888	250 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	TPPP	O94811	219 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	AGA	P20933	346 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ART1	P52961	327 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM166A	Q6J272	317 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	VWA1	Q6PCB0	445 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GVI7	797 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS44	E7EML9	344 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	C19orf84	I3L1E1	186 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SYT7	O43581	403 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	SULT1B1	O43704	296 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	DOK2	O60496	412 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FCGR2A	P12318	317 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	MNDA	P41218	407 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CX3CR1	P49238	355 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	PRKX	P51817	358 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM27B	Q5VT28	67 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OR2A2	Q6IF42	318 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	HAVCR1	Q96D42	359 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GTI1	187 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LANCL1	O43813	399 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	NTF4	P34130	210 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	KIR2DL3	P43628	341 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	LUZP2	Q86TE4	346 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	YIPF5	Q969M3	257 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CST2	P09228	141 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	OPRM1	P35372	400 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	RANBP1	P43487	201 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	DGCR2	P98153	550 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TMEM18-208	ENST00000497508	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		12.75	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms