RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BLMH	Q13867	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPCS2	Q15005	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PDCD1	Q15116	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TAF13	Q15543	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HFE	Q30201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RFX4	Q33E94	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		Q6ZSV7	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PITX2	Q99697	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ARPC3	O15145	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RER1	O15258	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SURF4	O15260	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CIB2	O75838	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TXNDC12	O95881	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SFTPB	P07988	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPARC	P09486	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	COX5B	P10606	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF250	P15622	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PYCR1	P32322	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CD80	P33681	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LIPA	P38571	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MPV17	P39210	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	WNT5A	P41221	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MAGEA2	P43356	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GSS	P48637	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ERF	P50548	548 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RAD23A	P54725	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	EGR3	Q06889	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MALL	Q13021	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FHL1	Q13642	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GK3P	Q14409	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MEP1B	Q16820	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953		Q6YL49	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	USP51	Q70EK9	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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