RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 GAGE12FP0CL80 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GAGE12GP0CL81 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GAGE12IP0CL82 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PTHLHP12272 177 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NTSR1P30989 418 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CYB561P49447 251 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ATP1B3P54709 279 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TROAPQ12815 778 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GAGE4Q13068 117 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TM4SF20Q53R12 229 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ACER3Q9NUN7 267 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EMCNQ9ULC0 261 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 V9GYY9 64 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PZPP20742 1482 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GWB2 263 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM150BA6NC51 233 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF749O43361 778 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LDB2O43679 373 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DUX1O43812 170 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 B4GALT3O60512 393 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 THY1P04216 161 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 WNT1P04628 370 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ADORA2BP29275 332 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 BCL6P41182 706 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TCP10Q12799 353 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MELKQ14680 651 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SSX8Q7RTT4 187 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MMP21Q8N119 569 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A4AQ96JQ5 239 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DUX5Q96PT3 197 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 OR4C12Q96R67 309 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A8Q9BY19 250 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 H3BMH7 237 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ACKR2O00590 384 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MSTNO14793 375 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SIVA1O15304 175 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CCL25O15444 150 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ENTPD3O75355 529 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GPR32O75388 356 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 IGHA1P01876 353 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ADRA2AP08913 450 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MZT1Q08AG7 82 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM225Q6GV28 225 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 RNF128Q8TEB7 428 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MZB1Q8WU39 189 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GLYATL1Q969I3 302 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EHFQ9NZC4 300 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB6Q5THR3 1501 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FCN1O00602 326 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TBL1XO60907 577 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NRASP01111 189 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HRASP01112 189 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 KRASP01116 189 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MAS1P04201 325 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CEACAM1P13688 526 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SDHBP21912 280 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ID1P41134 155 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PNPLA4P41247 253 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 LTBQ06643 244 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 Q56UQ5 140 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms