RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QL4Q86Z23 238 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4K13Q8NH42 304 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF799Q96GE5 643 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52D1Q9H346 318 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf123Q9NWV4 160 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFAF4Q9P032 175 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DVL1O14640 695 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARPC3O15145 178 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCN3O75636 299 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECDO95905 644 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DQA2P01906 255 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GYPAP02724 150 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCK1P16333 377 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A6P31641 620 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF92Q03936 586 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAI3Q3KNW1 292 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZSV7 163 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM90A1Q86YD7 464 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTSSAQ969W0 71 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP6Q96JE9 813 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRS1Q96LJ7 313 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FN3KQ9H479 309 aa10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGT3PA6NGU5 568 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NLC8 198 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10H3O60404 316 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIRAS1O95057 198 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANOS1P23352 680 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFX4Q33E94 735 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDONQ4KMG0 1287 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF826PQ6ZT77 177 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPERTQ8NA61 448 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDR9C7Q8NEX9 313 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52J3Q8NH60 311 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST8SIA4Q92187 359 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FUZQ9BT04 418 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf95Q9H693 158 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNG2Q9UJ96 466 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KPTNQ9Y664 436 aa10.86□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GVI7 797 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C68A6NDL8 312 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRPP07492 148 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOS3P29474 1203 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLYATL3Q5SZD4 288 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf34Q96L11 122 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT27Q9BW83 186 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTD2Q9H8S5 307 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNRD1Q9P1U0 126 aa10.85□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHBP01229 141 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBP1P09467 338 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX4I1P13073 169 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS27P42677 84 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MZT1Q08AG7 82 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT72Q14CN4 511 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRAM2Q6UX65 266 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFRL1Q8N441 504 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GW55 424 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf63A6NC05 138 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD17A6NE02 478 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHLHE40O14503 412 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4L2P0CJ85 424 aa10.83□□□□□ -0.68
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX4L3P0CJ86 424 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.3 ms